생물정보학 (Bioinformatics) 는 통계 (Statistics) 을 포함한 수학 (Mathematics) 과 정보기술을 사용하여, 보통 컴퓨터 프로그램, 수학적 모델들을 사용하거나 만들어서, 생물학적 문제들을 풀기위한 학문이다. 주요 영역중의 하나는 다양한 genome projects 에 의해 수집된 데이터 분석과 데이타마이닝 (Data Mining) 이다. 그외의 영역은 sequence alignment, protein structure prediction, systems biology, virtual evolution 등이 있다. 요약하면 다양한 genome project 는 많은 문자의 리스트 (many long lists of letters) 를 만들 게 되며, 생물정보학의 역할중 하나는 그러한 문자들의 단어 (words), 문법 (grammar), 문장 (sentences), 궁극적으로는 이러한 문자들의 의미 (기능적 중요성)를 결정하는 것이다. 이러한 분야의 발달은 암을 포함한 다양한 질병의 치료법을 발견하는데 궁극적으로 도움이 될것이라고 사람들은 희망하고 있다... (Wikipedia : Bioinformatics)
생물정보학은 영어로는 bioinformatics, computational biology, 또는 computational molecular biology 등의 용어로 불린다.
유전자 혁명은 정보의 범람을 낳았고 인공지능 (Artificial Intelligence) 은 과학자들이 실제로 사용가능한 유일한 방법일 수 있다. 모든 상식을 인간들이 공유하려는 노력은 AI 에 의해 Cyc 를 만들었으며 과학자들은 유기체에 대한 모든 정보를 모아놓을 수 있는 기술에 이르게 되었다 ........ 인간의 상식의 크기만큼이나 유기체에 대한 정보는 많기 때문에 과학자들은 박테리아같은 작은 유기물에서 시작하였다. 박테리아에 대한 모든 정보를 배움으로써, 과학자들은 박테리아를 어떻게 효과적으로 죽이며, 소위 공해를 먹는 박테리아 같은 것으로 바꿀 수 있는지를 배울 수 있다 ....... "생물학자에 의해 얻어진 엄청난 정보 때문에, 한사람이 유기체에 대해 알려진 모든 것을 가지는 것은 불가능하다" 라고 SRI International 의 Artificial Intelligence Center 의 Bioinformatics Research Group 의 디렉터인 Peter Karp ★★★ 는 말한다. "따라서 컴퓨터가 조작할 수 있는 형태로 하나의 유기체에 대해 알려진 모든 정보를 만들고, 과학자들이 접근할 수 있게 만드는 것이 중요하다." 라고 Karp 는 말한다. Karp 의 이러한 개념은 Pathway tools 라고 불리는 database software 플랫폼이다. 그 software 는 삶을 유지하려는 하나의 유기체에서 유전자에 의해 사용되는 생화학적 pathway 들을 모으고 정밀하게 표시한다(map out) ....... 1985 년에 Cyc 상식 프로젝트를 시작한 Douglas Lenat 와 일하면서 자극받은 Karp 는 Cyc AI 기술을 응용하여 소위 유기체에서 물질대사 경로 (metabolic pathway) 를 표시하기 위해 지식표현 (Knowledge Representation) 을 사용하게 된다. 비록 Cyc 프로젝트가 실망적이었지만, Karp 는 많은 과학자들이 의존하기 시작한 software 를 만들기 위해 AI 개념의 일부를 받아들였다 ....... Karp 는 1992 년에 대장균 (E. coli) 으로 시작하였다. 그와 동료들은 모든 정보를 수작업으로 입력해야만 했다. 그러나 지금은 Pathway Tools 로써 "컴퓨터로 추론" 하여 database 를 구축하는데 도움을 받는다. SRI 는 결핵을 위해 database 를 구축하고, 궤양을 일으키는 것으로 최근 발견된 H.pylori 와 다른 10 여가지를 구축하고 있다 ........ "EcoCyc (Biocyc) 를 사용한 것과 같은 것을 수작업으로 하면 수년이 걸릴 수 있다" 라고 Karp 는 말한다. 지금은 단지 수주일이 걸릴 뿐이다. 그 database 는 physical map (대장균 물질대사 지도) 에서 볼 수 있으며 기하학적 형태로 연결되어 있는 선과 대사물질같은 물질대사 경로를 보여준다. ........... Human Genome Project 는 하나의 지도로 불려왔다. 실제로 연구자들이 알아낸 것은 도시와 같은 것이었지만 도시를 연결할 도로가 없었다. 결코 끝낼 수 없는 열정이 있었다. 그리고 도시의 목록이 소설 '전쟁과 평화' 2000 권에 해당하는 많은 문자로서 구성되기 때문에, 전체의 지도 (full map) 은 몇개의 빌딩만큼이나 될 것이다 ........ (A Map That Maps Gene Functions)